微渦流反應球的絮凝機理主要包括微渦流凝聚和微渦流絮凝接觸兩個過程。

①微渦流凝聚是膠粒脫穩且生成微小聚集體的過程。由于水流在渦流反應器內外流動形成了渦流，使得流層之間存在較大的流速差從而在層流中的膠粒發生相對運動，這增加了膠粒之間的碰撞機率；同時，水流的渦旋運動形成離心力，使得膠粒發生徑向運動，這也增加了水中膠粒間的碰撞與接觸。因此渦流反應器形成的微渦旋流動可以增加水中膠粒擴散與碰撞的機率，同時混凝劑水解形成的膠�？煽焖贁U散，并與水中膠粒發生充分的碰撞使其快速脫穩，脫穩后的膠粒在微渦流作用下增加碰撞機率，從而提高了膠粒的凝聚效率。

②微渦流接觸絮凝是指水中脫穩的膠體、微小懸浮物聚結成大的絮凝體的過程。當水流流過渦流反應器時，反應器內部的流速小于外部流速，從而大量的絮體(礬花)懸浮集聚在反應器腔體的內部，對流過的已脫穩的膠粒進行吸附絮凝，即發生接觸絮凝。當渦流反應器腔體內的絮體增長到一定程度時，密實度較低的絮體在微渦流的作用下會發生破碎，破碎后重新進行絮凝成密實度較大的絮體，這樣有利干后續沉淀分離。